Coefficient de consanguinité connemara

obsonine

merci, je comprend un peu mieux le calcul, je retourne à mon sous-marin...

Toutes vos réponses sont hyper intéressantes !

obsonine Merci pour ce re-calcul, ça confirme avec des chiffres ce que je pensais un peu à vue de nez ..
Vous êtes partis un peu loin pour mes modestes connaissances en génétique, mais je trouve ça passionnant ... dans une autre vie, faudrait que je m'y penche :)

dadou_love j'ai mis a peu près 24 minutes à voir de quelle case tu parlais et encore je suis pas sure d'avoir la bonne ... Mais dans tous les cas, en effet, ce sont toutes ces petites redondances qui augmentent le taux.
Cependant le calcul d'Obsonine me parait moins "ahurissant" ..

kiiwii ça m'intéresse aussi si tu as des exemples concrets de tares suite à un trop fort taux de consanguinité.

Très concrètement, est ce qu'il y a des choses sur lesquelles je devrais être attentive sur cette pouliche lors de sa croissance en connaissant ce taux de consanguinité ?
J'ai pris note de faire les tests PSSM1 et HWSD par exemple, est ce que vous avez d'autres recommandations ?

Je précise que c'est une pouliche qui est dans les écuries où était ma vieille jument et qui me fait seulement de l'oeil pour l'instant ... Si j'en viens à me décider un jour-peut être-éventuellement-saitonjamais ( ), elle sera avant tout destinée à de la balade, rando, loisirs, ... La reproduction n'est pas l'objectif principal, loin s'en faut.
Dans tous les cas, avec moi ou pas, c'est une pouliche que j'aime beaucoup et si son actuel proprio ou les futurs peuvent partir avec toutes les bonnes infos, ce serait super !

Et en creusant un peu plus, Carna Dun est aussi l'arrière grand père de Fort Doolin. La boucle est bouclée !

kikoutoc

Pour les exemples de trop grosses consanguinités, par exemple, des chevaux positifs à pleins de maladies génétiques parce que les parents viennent des mêmes chevaux ^^'

Exemple, le cheval "E" est PSSM1/n et HYPP/n (exemple avec des QH : les connemaras n'ont pas d'HYPP)
Il a 1 chance sur 2 de transmettre la PSSM1 et une chance sur 2 de transmettre l'HYPP.

Si l'étalon et la jument qui ont fait le poulain ont le cheval "E" comme père/mère, le poulain pourrait être PSSM1/PSSM1 et HYPP/HYPP si les parents sont tous les deux positifs ou bien négatif aux deux si les parents sont négatifs aux deux.

Le mariage peut donc fixer le pire du cheval E, ou faire un cheval plus sain (du côté de ces maladies génétiques) que le cheval "E".
Le mariage peut aussi faire un poulain tout aussi malade que le cheval "E".

En gros, sans tester, c'est du hasard total, et du coup ni très éthique ni très intelligent et c'est évitable.

Par contre si on teste et qu'on ne fait se reproduire qu'une jument et un étalon issus du cheval "E" qui sont sains, on pourrait obtenir un poulain qui "ressemble" au cheval "E" mais sans ses problèmes génétiques, ce qui serait intéressant si le cheval "E" par exemple, est un cheval d'une race rare, ou est exceptionnel niveau patrimoine/performances.

Mais ça impliquerait des produits non sains qui, même si on ne les faits pas reproduire, auront toutes les chances de souffrir pendant toute leur vie (dans le cas d'hypp + pssm1).

En gros vaut mieux n'utiliser la consanguinité que si le cheval qu'on veut mettre plusieurs fois dans le pédigrée soit complètement sains autant au niveau conformation (parce que ça s'hérite aussi) qu'au niveau des maladies génétiques (faire tous les tests disponible pour le savoir) ou soit super spécial (faire ça avec pompom de la prairie, c'est pas du tout intéressant).


[pour l'HYPP et la PSSM1, j'ai pris un vrai exemple, qu'on bcp fais des éleveurs de QH quand ils ont trouvé qu' "Impressive" (c'est le nom du cheval) était particulièrement réussi et performant, sans que les maladies qu'il avait soient testables... du coup c'est évitable de nos jours]

kikoutoc
Bonjour,
Pourquoi certaines cases dans cet arbre généalogique sont-elles vides? N’est-ce pas simplement cette absence d’informations qui fait monter le pourcentage de consanguinité puisque calculé sur un plus petit nombre de parents connus?

sudest1

Merci, super intéresssant, on comprend mieux l'intérêt de faire tester, même un cheval sain !

flamine
Ah non, je connais le reste de la généalogie, j'ai juste mis les individus redondants dans le tableau. Cela me permet de conserver l'anonymat de la pouliche :)

kikoutoc le Connemara a une base restreinte de toute façon.
le 1er stud book date de 1924 et ne comptait que 9 étalons dont 4 ont encore des descendants mâles.
- Lignée Cannon Ball et son fils Rebel : InnishgoillnLaddie, Lavaley Rebel et Calla Rebel (fils de Rebel), autres descendants : Carna Bobby, Tooreen Ross, Kid de Coiselet etc...
- Lignée du pur sang Little Heaven : d'où Carna Dun père d'une floppée d'étalons et de bonnes juments - Fort Doolin - Little Heaven est aussi le pére de Stroller avec une connemara qui fut médaille d'argent JO Mexico.
- Lignée Connemara Boy : Dun lorenzo père de Mac Dara et Dun Aengus , Mac Duff, Morven Storm, Oia Sonn...(élévage Coiselet...)

Livres du stud book ayant des traces en France : Moutain Lad d'où Galway de la Dive, Cyrano Pondy, Cyndy de la dive...
La lignée de l'arabe Naseel par Clonkeehan Auratum : elevage du Blin, de Ravary

Source : revue n° 4 Connemara - décembre 1994 - AFPC

Tu es sûre de toi? je n'aurais pas dit comme ça. La consanguinité va certes baisser mais pas à trouver à zéro.

kikoutoc en connemara je ne sais pas. Mais en welsh je sais qu’il existe des croisements fils sur la propre mère.

En arabe aussi je me souviens avoir vu dans un magazine un croisement entre propre frère et sœur

obsonine est-ce que tu pourrais expliquer pourquoi le coefficients de consanguinité de la mère ne s’applique pas au poulain ?

cherchour Parce que tous les ancêtres reculent d'une génération, et que donc ça modifie tous les calculs.

Exemple : si un étalon saillit sa demi-sœur, il y a un ancêtre commun en génération 2.
Si la pouliche issue de cette union est saillit par un autre étalon, si on calcule sa consanguinité : on ne trouve qu'un ancêtre commun, en génération 3. Elle est beaucoup moins consanguine que sa mère ;)

pcql ah mais oui j’ai compris du coup merci

cherchour Le calcul du pourcentage de consanguinité permet d'évaluer le taux d'homozygotie d'un individu donné. Si son père et sa mère partagent des ancêtres communs, il y a une certaine probabilité que certains de ses allèles se retrouvent à l'état homozygote : hérités des mêmes ancêtres du côté du père et de celui de la mère.
Un individu avec un taux de consanguinité de 4% aura (en théorie) 4% de ses allèles à l'état homozygote*. Si par malchance, un de ces allèles est à l'origine d'une tare ou d'une pathologie, l'individu en sera doublement porteur.
Si les deux parents ne partagent pas d'ancêtres communs (ou alors trop éloignés pour être pris en compte dans les calculs), le risque d'avoir un allèle issu d'un même ancêtre en double est nul (ou quasi nul)

* j'entends par là, les allèles issus du même ancêtre (qu'on appelle IBD en génétique : Identical by Descent, par opposition à IBS : Identical by State)

Il y a aussi une autre façon de considérer la consanguinité : c'est la part du génome représenté par un ancêtre.
Par exemple, on retrouve plusieurs fois Island Earl dans le papier de la mère. Son génome contient donc une plus grande part de celui d'Island Earl que de celui de Fort Doolin (par exemple).

La mère va donc transmettre à la pouliche une plus grande part d'Island Earl, mais chaque allèle en un seul exemplaire. Si bien que si le père n'a pas d'Island Earl dans son papier, ou à une génération éloignée (comme ici), le taux d'homozygotie d'allèles issus d'Island Earl reste très faible.