Consanguinité pour un étalon

gobi a écrit le 21/08/2012 à 13h04: Et puisque vous avez l'air callés, est-ce que quelqu'un porrait me traduire ça : XX=12.01% - OX=1.17% COI=1.68457% Merci d'avance !

trouvé sur internet :
"XX représente le pourcentage de Pur-Sang dans un pedigree. OX est la part de Pur-Sang Arabe.
Le calcul se fait en additionnant les taux XX et OX du père et de la mère et en les divisant par deux.

Par exemple, un cheval ayant pour père un PS (XX=100 et OX=0) et pour mère une PsAr (XX=0 et OX=100) aura un XX=50% et un OX=50% aussi. Ce même cheval, croisé ave un PS donnera un produit ayant XX=75% et OX=25%."

donc traduction (là c'est vraiment des termes équestres, donc moins mon domaine):
ton cheval à 12.01% de PS et 1.17% de PSA
son taux de consanguinité est de 1.68457%
(est ce juste comme traduction My-jerk?)


Par contre ton schema perso je ne suis pas d'accord le chien à 0% vu plus haut a reproduit avec une chienne à 21.89% (voir le pedigree ici: http://www.chiens-de-france.com/site_eleveur/index.php?rub=chiens&page=fiche&ID_ELEVEUR=22629&ID_SITE=24050&ID_CHIEN=503389&TABLE=t_chien_03&TITRE= )
Résultat les chiots sont à 2.91%

Donc tu n'es pas d'accord avec les HN et leurs ingénieurs

Avec l'idée que la consanguinité ne se transmet pas, mon schéma est juste et colle avec l'exemple 2 que j'ai cité.

Soit il y a une subtilité qui m'échappe avec le coefficient de consanguinité, soit les méthodes de cacul sont radicalement différentes, mais je suis sure de moi quand je dis que c'est ce que les haras expliquent.

Pour l'explication des XX et OX, c'est juste

my-jerk a écrit le 21/08/2012 à 14h09: Hé bien la méthode de calcul est différente alors. Ce que je te présente est directement issu du raisonnement des HN.

Oui je ne comprends vraiment pas, car je connais 2 personnes (veto) du secteur génétique avec qui j'ai appris justement (1 à l'ENVA et l'autre à coté de Nantes), pour eux dans toutes les espèces la transmission reste la même (le casse tête )

Mais peut-être à voir avec ce que je disais plus haut certains font une différence entre consanguinité et dilution du sang...

my-jerk a écrit le 21/08/2012 à 14h18: Donc tu n'es pas d'accord avec les HN et leurs ingénieurs Avec l'idée que la consanguinité ne se transmet pas, mon schéma est juste et colle avec l'exemple 2 que j'ai cité. Soit il y a une subtilité qui m'échappe avec le coefficient de consanguinité, soit les méthodes de cacul sont radicalement différentes, mais je suis sure de moi quand je dis que c'est ce que les haras expliquent. Pour l'explication des XX et OX, c'est juste

Non ton schéma ne colle pas, la personne dit: COI (Coefficient Of Inbreeding)=1.68457%
donc pas 0...

Bah écoutes, je ne vois que ça Je ne vois pas pourquoi ça changerait entre espèces, la transmission de la génétique est la même...

Je pense qu'il y a une différence d'appellation, et qu'à priori le coefficient de consanguinité affiché par les HN n'est pas tout à fait la même chose que ce dont toi tu parles. Mais pourquoi

alicane a écrit le 21/08/2012 à 14h22: Non ton schéma ne colle pas, la personne dit: COI (Coefficient Of Inbreeding)=1.68457% donc pas 0...

Bah pour ce cas, on a pas la généalogie, donc je veux bien croire que le COI est de 1.68%, si c'est ce qui est marqué. Je parlais de mon exemple des HN, celui ci:

Exemple 2 :
E l'étalon a un cœfficient de consanguinité = 0,08 (8%) et J la jument avec laquelle il a été accouplé possède de son côté un cœfficient de consanguinité =0,06 (6%).
E et J n'ont aucun ancêtre en commun dans leur généalogie, le cœfficient de consanguinité de leur produit sera nul (0%) du fait de leur non apparentement.

venant de là:
http://aide.haras-nationaux.fr/index.php?id=174

Je viens de me pencher sur le COI des chiens, et j'ai trouvé ça:
http://www.braquedubourbonnais.info/fr/calcul-consanguinite.htm

En bas de pages, ils disent:


Cas d'un ancêtre commun dont le coefficient de consanguinité est non nul :

Dans le cas ou un des ancêtres communs a un coefficient de consanguinité non nul, on affecte à chaque chemin passant par cet ancêtre le coefficient (1 + F) dans le calcul.


Je pense que la différence vient de là. Si c'est également fait avec les ancètres non communs mais consanguins (il faudrait vérifier ce point du coup), alors il n'y a jamais de COI à zéro à partir du moment où il y a un animal consanguin dans la généalogie.

oui c'est ce que je te disais ici (c'est ce passage que j'ai vu):

Citation : Je viens de voir le site des HN, effectivement ils parlent d'annuler, là je ne comprends pas bien Peut-être distinguent-ils consanguinité et la dilution du sang? J'ai déjà entendu parler d'un truc du genre, faudrait que je recherche : -Certains parlent de consanguinité seulement pour un mariage qui est fait avec des géniteurs communs, et d'autres parlent de dilution du sang. -D'autres disent que c'est en résumé la même chose...

je m'imisce , je n'y connais rien , mais en vous lisant , on dirait juste que les HN ne considerent que les parants , s'ils n'ont rien en commun c'est zero meme si l'un des parents ets issu lui-meme de parents consanguins , par contre pour les chiens , il semblerait que rien ne s'annule , que le calcul canin ne prend en compte seulement le lien ou l'absence de lien de parenté des parents que l'on croise, pour les chiens le calcul tient compte au delà des 2 parents
je ne sais pas si c'est clair

Donc entre chiens et chevaux, la méthode diffère

spaghett a écrit le 21/08/2012 à 14h38: je m'imisce , je n'y connais rien , mais en vous lisant , on dirait juste que les HN ne considerent que les parants , s'ils n'ont rien en commun c'est zero meme si l'un des parents ets issu lui-meme de parents consanguins , par contre pour les chiens , il semblerait que rien ne s'annule , que le calcul canin ne prend en compte seulement le lien ou l'absence de lien de parenté des parents que l'on croise, pour les chiens le calcul tient compte au delà des 2 parents je ne sais pas si c'est clair

C'est ça. Les HN considèrent que la consaguinité ne se transmet pas, donc une nouvelle souche annule toute consaguinité sur le produit. Alors que chez le chien, c'est effectivement en terme de dilution sur plusieurs générations.

j'ai l'impression que les chevaux on annule tout si les parents n'ont rien en commum , pas chez les chiens

on a ecrit en meme temps , mais on est d'accord
donc le systeme n'est pas comparable quoi
peut-etre du au fait de la rapidité de repro chez les canins par rapport aux equin qui n'ont naturellement qu'un poulain par an , alors qu'une chienne aura 2 portees et peut donc produire une vingtaine de descendants par an

La méthode des HN ne me semble pas abbérante, dans le sens ou le poulain reçoit moitié de son père, et moitié de sa mère. La consaguinité n'a de sens que sur 2 chromosomes. Un animal consanguin l'est parce qu'il a un taux d'homozygotie plus élevé qu'un autre. Si vous accouplez ce consanguin avec un autre, alors cette notion d'homozygotie disparait. Consanguin ou non, il ne donne que la moitié de ses gènes...

my-jerk a écrit le 21/08/2012 à 14h37: Je viens de me pencher sur le COI des chiens, et j'ai trouvé ça: http://www.braquedubourbonnais.info/fr/calcul-consanguinite.htm En bas de pages, ils disent: Cas d'un ancêtre commun dont le coefficient de consanguinité est non nul : Dans le cas ou un des ancêtres communs a un coefficient de consanguinité non nul, on affecte à chaque chemin passant par cet ancêtre le coefficient (1 + F) dans le calcul. Je pense que la différence vient de là. Si c'est également fait avec les ancètres non communs mais consanguins (il faudrait vérifier ce point du coup), alors il n'y a jamais de COI à zéro à partir du moment où il y a un animal consanguin dans la généalogie.

sauf pour A'brambledale black bob, c'est un chien importé issu de titre initial, origine working bearded (le bearded collie a 2 lignées: les working et les standard).
Ce chien est le pédigrée que je t'ai mis à 0
Lui marié avec une chienne lignée standard avec plus de 21% de cons, produit des chiots avec un taux faible, mais pas de 0.
Là on a vraiment aucun lien entre le male et la femelle d'établie (les working sont issus de croisements en Angleterre pour résumé, donc la lignée n'est pas très traçable et encore moins pour le logiciel).

Je pense vraiment que les HN parlent de consanguinité en cas de lien entre le male et la femelle et autrement nous parlons bien de dilution de sang (bref une autre interprétation de consanguinité)... Je ne vois que ça (on a prouvé toutes les 2 que nos arguments se valent je pense...)